Кара но шоджо - Второй эпизод погружает пользователей в атмосферные приключения детектива Рэйдзи Токисаки, перенося события в декабрь 1957 года. Главный герой пытается отыскать потерявшуюся девчонку по имени Токо, безуспешно проворачивая множество махинаций в процессе расследования. Протагонисту кажется, что пора уже смириться и принять смерть девушки, но тяга к исследованию и внутренние чувства берут вверх над здравым смыслом, направляя юношу на затяжные поиски.

Сюжетная линия в "Девушка в скорлупе: Второй эпизод" рассказывает про попытки отыскать исчезнувшую даму в тот период, когда на улицах города свирепствует жестокий маньяк. Предстоит параллельно вести два дела, чтобы докопаться до истины и вычислить убийцу. Преступник убивает своих жертв, вскрывая животы при помощи ножа и помещая внутрь загадочную глиняную куколку, напоминающую ребенка. Рэйдзи берется за работу, стараясь найти следы жуткого человека, занимающегося извращенными пытками над простыми гражданами.

Город находится в опасности, а обитатели под страхом стать следующей жертвой маньяка. Игрокам придется наблюдать за развитием интерактивной новеллы, наполненной психологическими элементами триллера. В процессе приключений молодого частного детектива геймеры наткнутся на множество интригующих сюжетных поворотов и смогут докопаться до истины мрачных и бесчеловечных преступлений, чтобы спасти потерявшуюся девушку Токо.