Mortal Kombat Ultimate MK6 – измененная третья часть. Добавлены многочисленные элементы, меняющие прохождение, навыки персонажей, игровые территории и режимы. Геймплей включает дополнительную битву 2х2, похожую на матчи на выносливость в первой части. В "Турнире" может участвовать до 8 пользователей, где победители продвигаются по сетке до тех пор, пока не встретятся в финале.

Ключевые нововведения и изменения в Мортал Комбат - Ultimate MK6:
- Подопечный способен совершать комбинации, начиная с удара рукой или ногой в воздухе. Это поможет наносить больше урона по сопернику и добавило больше тактик.
- Многие бойцы получили новые комбо, а их анимации ударов улучшились. Урон от мощных комбинаций был снижен, восстановив баланс.
- Изменены движения персонажей. К примеру, Кабал не способен применить навык "Земляная Пила" после того, как раскрутил соперника, что позволяло наносить много урона.
- В данной части Саб-Зиро стал слабее, поскольку не может ставить ледяного клона, находясь близко к оппоненту.

Помимо этого, в проекте добавились незначительные элементы. Красный портал поменялся на синий. На интерфейсе теперь отображается шкала "Мастер". В матчах на выносливость геймер способен столкнуться сразу с 2 или 3 противниками за один раунд, проверяя свои способности. Как и в предыдущих версиях, юзер возьмет управление над Шао Каном, Шивой, Скорпионом, Кабалом, Соней, Сектором, Лю Каном и другими воинами.