Веселая ферма 3: Мадагаскар переносит геймеров вместе со Скарлет в Африку. Девушка решает просто устроить себе каникулы, но ей снова пришлось работать. Оказалось, что местный заповедник находится в ужасном состоянии. Вдобавок местные звери заболели, потому что кто-то отравил источник. Главная героиня решает заработать деньги, чтобы помочь им. С этой целью она снова строит свой бизнес.

Также оказывается, что крупная корпорация World Diamond хочет выкупить тропическую землю себе, так как на её территории обнаружены месторождения алмазов. Farm Frenzy 3: Madagascar сочетает в себе симулятор фермы и тайм-менеджмент. В данной версии все животные – новые. Появились цесарки, буйволы, страусы и слоны. Их надо разводить, а произведенную ими продукцию – перерабатывать в товары на продажу. Производством одной еды дело не ограничивается. Кроме тортов и прочих вкусностей необходимо выпускать сувениры, костюмы и ювелирные изделия.

Цель игры состоит в том, чтобы заработать достаточно денег, очистить всю воду, купить лекарства для зверей и превратить находящийся в упадке участок в райское место. Как и раньше, имеется два режима. Можно последовательно проходить уровни в карьере или развлекаться в бесконечной игре. Всего здесь 90 этапов. Каждый из них нужно успеть завершить за определенное время. Постепенно становятся доступными различные рецепты и здания. Периодически на фермерские угодья пробираются орангутаны. Их надо ловить, иначе они будут разрушать здания и красть созданий.