Игровой процесс в игре "We Are Not Alone" сочетает в себе два популярных жанра: хоррор от первого лица и приключения от третьего лица. Уникальная механика камеры создает новое ощущение напряжения. Посмотрев сквозь камеру, игрок безопасно исследует мир, так как существо не может встретить его взгляд. Однако установка камеры необходима для решения головоломок обеими руками, но это оставляет игрока уязвимым.

История игры следует за Райли, чьи заботы выходят за рамки апокалипсиса, охватившего мир. Три месяца назад сестра Райли подала заявку на работу в Осирис Инициативе, мировом лидере в медицинской технологии. Несмотря на наличие способа связаться с ней изначально, ежедневные общения прекратились. Что-то не так. Пытаясь найти свою сестру, воспользовавшись связями на ее работе, Райли уволена за грубое нарушение без объяснений. Подавшись на испытуемого в Осирис Инициативе, Райли надеется получить информацию об этой загадочной организации и в конечном итоге найти свою сестру. Правда ли, что эксперимент безопасен, как им обещали?

Особенности игры включают в себя исследование обширного комплекса, разгадывание тайн эксперимента и попытку выжить. Решайте головоломки, используя найденные предметы во время изоляции. Столкнитесь с давно утраченной цивилизацией... которая может оказаться не такой уж дружелюбной. Используйте камеру для исследования от первого лица и установки ее для решения головоломок от третьего лица. Игра имеет несколько концовок, зависящих от выборов игрока.