H.A.D.E.S Zero — это игра в жанре survival horror, разворачивающаяся в научно-исследовательском комплексе H.A.D.E.S Charon. Игроку предстоит взять на себя роль Ника Смита, агента безопасности, который пытается выжить после масштабной биотехнологической катастрофы, приведшей к разрушению станции. В условиях заброшенных коридоров и пустующих лабораторий игроку необходимо постоянно искать ресурсы, поскольку запасы еды и медикаментов строго ограничены.
Выживание в этой игре требует внимательного подхода к управлению инвентарем, а также бережного отношения к каждому найденному предмету. Атмосфера игры задает ритм, в котором каждое принятое решение может иметь серьезные последствия. H.A.D.E.S Zero использует кинематографические фиксированные камеры, которые показывают события с заранее заданных углов, тем самым ограничивая видимость игрока на потенциальные угрозы. Сражения с необычными существами, обитающими в комплексе, не предполагают прямого противостояния, а требуют тщательной стратегии из-за недостатка боеприпасов и медицинских средств.
Исследование окружающей среды играет важную роль в игровом процессе, побуждая игрока тщательно обыскивать каждую комнату в поисках инструментов, ключей и записей. Эти объекты необходимы как для продвижения по сюжету, так и для понимания произошедших событий. История раскрывается через фрагменты информации, такие как секретные документы, личные дневники и корпоративные заметки, найденные на территории комплекса. Они постепенно проливают свет на загадки проекта Human Advanced and Development Experimental Systems и его главных созданий — Прото-Альф, жестоких гибридов человека и насекомого.